Gerçek olaylardan hareketle yola çıkan manhunt unabomber ünlü bombacı Ted Kaczynski’nin (Paul Bettany) hayat hikâyesini anlatıyor. Ted başarılı ve kariyerli bir bilim adamı olacak yerde, yeteneğini bomba yaparak harcıyor. Üniversitelere ve havayolu şirketlerine şüpheli bomba paketleri gönderiyor. Ted’in tek amacı vardır. Yazdığı manifestonun hükümet tarafından kabul edlip, yayınlanmasıdır. Aksi takdirde bombalama eylemlerine devam edecektir.
FBI, Ted’in yakalanması için bütün ajanlarını görevlendirir. Profil uzmanı olan Jim (Sam Worthington), Ted’in kimliği hakkında büyük yol kaydeder. Dizide sürekli olarak geçmişe ve günümüze gel-gitler yaşanır. Jim’in çocukluğu, gençliği ve Ted’i yakalama zamanı sürekli irdelenir. Ted’in yakalama sürecini belgesel tarzında anlatılmasından sonra, Ted’in suçlamaları kabul etmemesi ve sadece Jim’le konuşmak istemesi ön plana çıkıyor.